1644年9月荷蘭上尉匹德澎 (Piter Boon) 奉命率兵遠征基隆、淡水，因遭遇拍瀑拉族的強烈反擊而未果。
1645年1月匹德澎再度率兵前往征戰，大肚王Quata Ong不敵，乃在荷蘭牧師的居中協調下臣服於荷蘭東印度公司。
同年4月7日荷人召開南部的地方會議，大肚王Quata Ong也前往，與東印度公司訂約，表示臣服。
大肚王國自此進入半獨立狀態，直到西元1662年荷人離台為止。
大肚王之役
而漢人對平埔族的第一次大屠殺始於「開台聖王」-東寧王國國父鄭成功，當初鄭成功強迫平埔族勞役，由於過於殘酷壓迫，導致平埔族反抗，其後果是大屠殺。
西元1661年，鄭成功率領兵艦開進鹿耳門溪，從北線尾登陸，鄭軍圍困熱蘭遮城，第二年2月荷蘭人投降結束了38年的統治。
《熱蘭遮城日記》記載：1661年6月3日前幾天，鄭軍帶了2千人及30名荷蘭俘虜出發到島上的番社，想要試探一向對荷蘭人表示友善的大肚王是否有歸降之意。
大肚王的臣民先提供鄭師士兵的索求，待鄭軍鬆懈之後率番丁突襲鄭營，並事先告知荷蘭俘虜以為應變。
當夜發動攻擊，約有1500名士兵被殺，其餘躲入甘蔗園逃生，大肚王放火燒園迫使殘軍出來，予以殲滅。
此一戰役也記載於《諸羅縣志》及《苑裡志》等書，並在民間廣為流傳，直到近70年前才為人所淡忘。
6月時，鄭軍將領張志與黃昭遣發屯墾北路。因為縱管事楊高凌削土番，激發大肚番阿德克故浪(A Tek Kaujong)殺死楊高並圍攻軍營。
於是鄭成功先遣副將楊祖解救，但被阿德克故浪以山豬標槍所殺。於是鄭成功再派黃安、陳瑞二將領征討。最後以伏擊戰術斬殺阿德克故浪。
重新發覺的這段史料，台灣史上最早反抗「外來政權」的光榮戰役，其紀念價值並不亞於「霧社事件」，是台灣史上值得紀念的一天，他考證大肚王之役的時間應為農曆的7月21日或國曆的8月15日前後。
被原住民打敗的鄭成功憤而遷怒於荷蘭人，於是下令把荷蘭人與傳教士釘在十字架，又把懷孕的荷蘭婦女剝腹，取出胎兒洩恨。
而大肚王的族人對鄭軍的抵抗並未停止，也從來沒有歸順明鄭，因而揚名於海內外。
鄭氏政權變荷人的間接統治為直接統治，平埔族人不能忍受鄭氏政權的奴役時，反抗就起來了。
如1661年大肚社之役(此大肚係在赤崁一帶)、1670年沙轆社之役、1682年竹塹、新港等社之役。然而，弱勢的平埔族，每一次的反抗，只有引來更殘酷的屠殺。
荷蘭人敗退換了「鄭氏王朝」，鄭氏立刻對平埔各族進行迫害，甚至滅社屠殺，鄭軍傾力強佔平埔各族的土地，即：「以各社土田，分給水陸諸提鎮……令兵丁俱各屯墾。」(海上見聞錄)更分遣官吏，向平埔各族徵收重稅。
沙轆社大屠殺
1662鄭成功死後，鄭氏佔領南台灣後，1664年實施「寓兵於農」的策略，也就是諸將士平日分散各耕地，按鎮分地、按地開墾。此行動不但造成原住民失去其傳統生活領域，更面臨嚴重的生存危機，導致雙方發生數次衝突。
西元1670年，大肚社、沙轆社、斗尾龍岸社舉兵反抗……..
東寧王國屠殺軍主帥劉國軒出兵消滅拍瀑拉族沙轆社「番」，番俗六考約：「沙轆番，原有數百人，為最盛，後為劉國軒殺戮殆盡，只餘六人，潛匿海口。」大肚社「番」懼怕而逃入埔里，「………鄭氏繼至，立法尤嚴，誅夷不遺妻子………，今大肚、牛罵、大甲、竹塹諸社林莽荒穢不見一人………」(裨海紀遊)。最悽慘的，要算是沙轆社了。
劉國軒（1629年－1693年），字觀光，福建汀州長汀人，另一說為武平人，為鄭氏王朝重要的軍事領袖。
劉國軒善於利用間諜，掌握敵軍的詳細動向，因此經常戰勝，才有「劉怪子」這綽號的產生。在澎湖海戰擔任統帥，卻被施琅擊敗。(戰後主張投降，東寧王國因此滅亡)。
沙轆社原本有數百人，可是劉國軒一進去之後，殺得只剩下6人，連小孩都不留。
西元1682年，鄭軍差派道卡斯族「土番」供勞役，接運米糧軍餉，只因為道卡斯人習慣用頭頂或背部載重，不會漢人以肩負重的方式挑物，竟然遭受鄭軍無情的鞭撻。
誠如潘英在《台灣平埔族史》一書中所中的：「鄭氏對平埔族而言，不僅是第2個外來政權，而且是不公不義的暴虐政權。」鄭成功的暴行比荷蘭人還可惡~
從東寧王國到清雍正年間，大肚王國一再被外來政權侵擾，平埔族人之土地也被漢人佔領，致生活困難，5個平埔族乃於清道光3年 （1822年） 遷移至現在的南投埔里。
沙轆之役是漢人入墾中部之濫觴，其發生和後果很像1947年的「二二八事變」，都是外來勢力以平亂為藉口，以優勢武力大量殘殺在地人，使在地人從此一蹶不振。
鄭據台22年屠殺不斷，台灣頭到台灣尾，血跡斑斑記於史冊：
（1）諸羅（嘉義縣市）不歸順者盡殺。
（2）搶佔水沙連（林圯埔至斗六間）住民之地不從者殺。
（3）登陸車城鎮壓瑯嶠（恆春）。
（4）屠殺屏北居民記在「番俗六考」。
（5）追殺北港溪上游雲嘉交界之住民。
（6）攻殺台南赤嵌住民占據臺江沿岸，載於「臺灣外記」。
（7）「番俗六考」又記：「沙轆原數百人，為最盛，後被鄭遣劉國軒殺戮，只餘六人，潛匿海口」。
（8）踏平貓兒干南社（雲林崙背褒忠），屯兵於黃地崙。
（9）鄭經趕殺竹山住民。
（10）「海上事略」載：「偽鄭守雞籠，凡需軍餉，悉差土番（住民）接遞，男女老樨供役，督運辦日酷有加，施鞭韃，因相率為亂，殺諸社商往來人役，新港仔、竹塹等社皆叛。鄭克塽令左協陳絳率兵剿擒，土番（住民）盡遁入山」。
東寧王國滅亡後，1731年（雍正九年），清廷官吏對原住民指派勞役過多，引起台灣平埔族群起反抗，發生「大甲西社番亂」（大甲西社抗清事件），清軍利用岸里社「以番制番」，翌年被鎮壓下來，各族人陸續逃離原居地，遷往埔里（南投縣北部）一帶，大肚王國翌年亦告瓦解。
資料來源:
國立花蓮師範學院鄉土文化研究所
中央研究院平埔文化資訊網
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